急性腸胃炎發燒39℃，通常由食物中毒或感染導致，建議及時選擇正規醫院就診，完善檢查，採取對症治療，避免病情加重。
發現發燒39℃持續高燒不退時，要先去醫院完善血培養、大便培養及大便常規等檢查，結合近期吃的食物，查明致病微生物，明確病因。
根據藥敏試驗結果，遵醫囑選擇針對性的抗生素治療，如諾氟沙星、慶大黴素等進行抗感染治療，從而控制炎症。
1、補液：高熱出汗較多者需警惕脫水的發生，可根據情況給予口服補液鹽或靜脈補液以預防水、電解質紊亂；
2、解痙止痛：伴有劇烈腹痛者可應用阿托品、複方顛茄片緩解疼痛；
3、止吐、止瀉：可應用蒙脫石散、甲氧氯普胺等緩解嘔吐、腹瀉的症狀；
4、物理方法：可以應用冰敷或用涼水、酒精擦拭身體，利用液體揮發帶走身體的熱量，從而達到降溫的目的，或者使用退熱貼等也可以達到相同的效果；
5、其他：如果查明爲食物中毒引起，必要時可通過洗胃儘量減少攝入有毒物質，也可在醫生指導下應用對應的解毒藥物。
建議改善日常飲食結構，以清淡、易消化飲食爲主，如米粥，多吃水果、蔬菜，保持規律飲食，做到少食多餐，禁食生冷、堅硬、辛辣、刺激以及不潔食物，避免引起腸道感染，如果出現嘔吐、腹瀉等症狀，建議禁食，及時去醫院就診。
