益母草膏是純中藥製成的，如果一般是正常的血瘀導致的月經不調服用是沒有問題的，但是如果是其他原因導致的月經不調，服用過多就會導致月經量的增多，或者出現拖尾的現象。雖然它是婦科良藥，但是益母草膏還是不能長期服用的，最好不要自行延長服用時間，聽取醫生的建議。
不過也有研究表明益母草是有副作用的。益母草膏會加重痛經，導致產後宮縮痛，而一些實驗發現，用益母草膏餵養孕兔會引起流產的現象。同時還具有腎毒性，可以引起大鼠腎間質輕度的炎症和少量的纖維組織增生，以及腎小管的輕度脂肪變。臨牀上也有益母草膏導致急性腎功能衰竭的報道。
在服用了過量的益母草膏後會導致腹瀉腹痛，如果有過敏現象的人甚至患者還會出現皮膚髮紅，心慌氣短，胸悶，呼吸加快的症狀。同時還會刺激跟懷孕有關的乳腺奧的增長問題。如果服用過程中發現自己有這些現象，都要立即的停藥，馬上去醫院就診，避免發生必不必要的意外。
