蜂王漿的副作用，雖然極爲罕見，但是是很嚴重的。不過，如果採取適當方法和謹慎的態度，潛在的副作用，可完全避免。這些副作用包括：溼疹、皮疹、咳嗽、光頭暈、心率增加等。一般這些都見過，但最初，隨着每一次用量減少，蜂王漿的過敏反應也就慢慢消失。蜂王漿的副作用主要有以下幾個方面：對於過敏體質者：這些人可能對蜂王漿中的一些物質起反應，出現氣喘、呼吸困難、皮疹、皮膚瘙癢等過敏症狀。對於低血壓患者：蜂王漿中含有類似乙酰膽鹼樣物質，能使血壓降低，因此可導致低血壓患者病情加重。對於腹瀉、腹痛及胃腸功能紊亂者：蜂王漿可引起胃腸道強烈收縮，會使原有症狀加重。對於肥胖者：蜂王漿可使機體內部調節能力加強，會使胖人變得能吃能睡，體重增加，易罹患其它疾病。對於糖尿病患者：蜂王漿含有大量葡萄糖，服食後可使血糖升高。對於發熱、咯血及黃疸病患者：服用蜂王漿後會促使病情綿延不愈，甚至有惡化的可能。
