1、花椰菜在腸胃中分解後容易引起脹氣。不過，如果在烹調花椰菜時加一些大蒜、胡椒、小茴香等辛辣調料，便可以大大減少脹氣的不適，還有利於增進食慾，幫助消化。
2、花椰菜容易生菜蟲，在生長的過程中，有些人爲了減少菜蟲對花椰菜的殘害，會噴灑大量的農藥，再加上花椰菜表面凹凸不平，更易積蓄農藥殘留，所以吃花椰菜前應先放鹽水中浸泡5分鐘，以去除殘留農藥和菜蟲。
3、注意食材的搭配。花椰菜中含有少量導致甲狀腺腫大的物質，經常食用者應注意補充碘，如加入碘鹽或食用海藻等海味食物。另外，花椰菜不宜與豬肝和黃瓜同食。花椰菜纖維中的醛糖酸基容易與豬肝中的鐵、鋅等微量元素發生反應，因此兩者同食會導致人體對這些元素的吸收大大降低；豬肝中的銅、鐵元素還會使花椰菜中的維生素C氧化爲脫氫抗壞血酸，失去原來的功效。
4、花椰菜不耐燒煮，宜急火快炒，儘量選擇短時間加熱的方法，斷生之後馬上盛出，這樣才能保持清香脆嫩的口感，使營養素與抗癌成分不致破壞和丟失。而且花椰菜切好之後不能久放，因爲在室溫空氣中放置6小時後，其抗癌成分的損失率可達75%之多。
